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Até a vinda de Martim Afonso de Sousa, os únicos núcleos existentes na costa brasileira eram as feitorias, com alguma fortificação para enfrentar os ataques dos índios e dos estrangeiros. Nessas feitorias ficavam alguns portugueses, encarregados de acumular os produtos da terra, principalmente pau-brasil, depois transportados para Portugal.
Foi Américo Vespúcio, que veio na segunda expedição exploradora, de 1503, quem fundou, já em 1504, a primeira feitoria na costa brasileira: a de Cabo Frio, onde ficaram vinte e quatro homens. Nos anos seguintes outras feitorias foram fundadas, principalmente no Nordeste, pois o pau-brasil era aí mais abundante e de melhor qualidade.
Com a criação das capitanias hereditárias foram fundadas vilas no Brasil. Apenas a primeira, a de São Vicente, tinha sido criada alguns anos antes, em 1532, por Martim Afonso de Sousa. Quanto à povoação de São Paulo, teve ela origem no colégio do mesmo nome, criado, em 1554, pelo padre José de Anchieta, no planalto de Piratininga. Mais tarde se tornou vila e, em 1711, passou à categoria de cidade.
Ainda na capitania de São Vicente, durante o século XVI, foi fundada por Brás Cubas a Vila de Santos, que depois teve a aprovação de Tome de Sousa.
Na capitania de Pernambuco ou Nova Lusitânia foram criadas pelo donatário, Duarte Coelho, as vilas de Olinda e Igaraçu.
Quando os holandeses ocuparam Pernambuco, transferiram a capital, até então em Olinda, para a povoação e porto do Recife, habitada por gente rude mas enriquecida no comércio. Depois da expulsão dos invasores, a capital voltou para Olinda mas Recife continuou a prosperar e por isso foi elevada à categoria de vila, o que provocou a inveja dos olindenses. Essa foi a causa da Guerra dos Mascates, pois mascates era o apelido que os habitantes de Olinda davam aos de Recife.
Outras vilas, criadas durante o século XVI, foram a de Porto Seguro, pelo donatário Pero do Campo" Tourinho, e a de Conceição, na capitania de Itamaracá.

Ao lado: Selvagem do Interior de Goiás, empregados  no   transporte   de   ouro.
(Conforme desenho de Debret).

A primeira cidade do Brasil foi a do Salvador, fundada por Tome de Scusa, em 1549, na baia de Todos os Santos. Para construí-la o governador-geral teve a ajuda dos jesuítas, chefiados pelo padre Manuel da Nóbrega; dos índios de Diogo Álvares, o Caramuru, e dos antigos colonos, que residiam na pequena Vila do Pereira e ti-, nham vindo para o Brasil com o donatário Francisco Pereira Cou-tinho. Foram logo construídas as primeiras casas, como a do Governo e a do Colégio dos Jesuítas. Também foram levantadas as for-tificações para a defesa da cidade contra o ataque dos índios e dos estrangeiros.
Ainda no governo de Tome de Sousa, o papa, ao nomear o primeiro bispo para servir no Brasil, escreveu no decreto ou bula, em lugar de Salvador, o nome São Salvador. Por isso até hoje a capital da Bahia é conhecida pelos dois modos.
A 1.0 de março de 1565 Está-cio de Sá fundou a segunda cidade do Brasil, a de São Sebastião do Rio de Janeiro, entre os morros Pão de Açúcar e Cara de Cão. O lugar, porém, por estar situado entre elevações, não permitia o desenvolvimento da cidade e por isso, em 1567, Mem de Sá resolveu transferi-la para o morro de São Januário, que também se chamou do Castelo e foi depois demolido.
Até 1763 Salvador foi a capital do Brasil mas, nesse ano, o ministro português Marquês de Pombal passou a sede da colônia para o Rio de Janeiro. A atual capital, Brasília, foi inaugurada a 21 de abril de 1960, durante o governo do presidente Juscelino Kubits-chek.
A última cidade fundada no Brasil, no primeiro século da colonização, chamou-se Filipóia de Nossa Senhora das Neves, mais tarde Paraíba, e atualmente João Pessoa. Seu fundador foi Frutuo-so Barbosa, empenhado na conquista da região dominada pelos potiguares. Esses índios eram amigos dos franceses e do chefe tabajara, o bravo Pirajibe.

a)    Feitorias e vilas

A primeira fcitoria: fundada por Américo Vespúcio em Cabo Frio   (1504). A primeira vila: São Vicente, fundada por Martim Afonso   (1532). A fundação da vila de Santos: por Brás Cubas (1546). As vilas fundadas por Duarte Coelho: Olinda e Igaraçu. Rivalidade entre Recife e Olinda:  Guerra dos Mascates.
Outras vilas do século XVI: Porto Seguro (na capitania do mesmo nome) e Conceição   (na capitania de Itamaracá).

A primeira cidade:  fundada por Tome de Sousa   (1549).
O nome São Salvador: erro na bula que nomeou o primeiro bispo.
A segunda cidade: fundada por Estácio de Sá, entre os morros Pão de Açúcar e Cara de Cão (1.° de março de 1565), chamada São Sebastião do Rio de Janeiro.
As capitais do Brasil: Salvador até 1763, Rio de Janeiro (até 20 de abril de 1960)  e Brasília.
A última cidade fundada no século XVI: Filipéia de Nossa Senhora das Neves