Simulamos a colocação da molécula em um banho de temperatura e viscosidade definidas. Existe um intervalo de tempo em que ocorre a transferência de calor entre o banho e a molécula e outro intervalo de tempo em que a molécula equilibra a sua energia, usamos as equações de movimento de Newton para calcular a posição e a velocidade de todos os átomos a cada intervalo de tempo. Através das equações de Newton para o movimento e do cálculo da energia potencial usando o campo de força, conseguimos simular o movimento da molécula.

Para moléculas muito flexíveis, com muitas ligações possíveis de giro livre que apresentam uma superfície de energia potencial complexa usamos

Alternativas:

a)
método da mecânica clássica
b)
método de Monte Carlo
c)
método da mecânica atômica
d)
método da mecânica quântica
e)
método da mecânica de newton