A Administração Pública foi estruturada nos poderes Executivo (exercido pelo presidente e seus ministros), Legislativo (Congresso Nacional) e Judiciário (representado pelo Supremo Tribunal Federal). Criado na época da Monarquia, o poder Moderador logicamente foi extinto, já que este era totalmente incompatível com a ideia de república. Além disso, foi estabelecida a importante separação entre Estado e fé, repassando diversos serviços públicos que até então eram oferecidos pela Igreja Católica novamente para as mãos do governo, principalmente na área da educação.

A Constituição reconheceu a divisão das províncias e o princípio da federação, ideia de que a União daria maior autonomia aos Estados e só interviria nos mesmos para manter a ordem ou em casos de invasão estrangeira. Inspirada na carta americana, tal concepção contou com o apoio massivo dos grandes latifundiários, que buscavam justamente o fortalecimento das oligarquias regionais e o enfraquecimento do poder central.

Uma curiosa norma da Constituição de 1891 estabelecia que os estrangeiros que por seis meses não manifestassem o desejo de conservar suas nacionalidades de origem, tivessem imóveis no Brasil e fossem casados com brasileiros também seriam considerados como de nacionalidade brasileira, de forma automática. Também foi a Carta de 91 que em seu artigo 3º previu a transferência da capital para o planalto central, realidade que se concretizou muito tempo depois, durante o governo de Juscelino Kubitschek.